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MYC多聚體促腫瘤機制

由 BioArt生物藝術 發表于 娛樂2023-01-21

簡介2022年11月23日,德國維爾茨堡大學Martin Eilers研究組與Elmar Wolf研究組合作在Nature上發表了文章MYC multimers shield stalled replication forks from RNA

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MYC多聚體促腫瘤機制

撰文 | 十一月

MYC家族蛋白驅動許多人類腫瘤的發展

【1】

。在正常的細胞中,MYC蛋白幾乎與所有的活性啟動子結合並透過RNA Pol II控制轉錄

【2-3】

。MYC蛋白也可以與DNA複製一起協調轉錄並促進與轉錄相關的DNA損傷修復。但是MYC蛋白是如何發揮這些多樣性功能的尚不清楚。

2022年11月23日,德國維爾茨堡大學

Martin Eilers

研究組與

Elmar Wolf

研究組合作在

Nature

上發表了文章

MYC multimers shield stalled replication forks from RNA polymerase

發現在轉錄延伸、mRNA剪接或者是蛋白酶體抑制的干擾下,MYC與活性啟動子中的許多結合位點分離形球形多聚體結構,泛素化依賴的MYC多聚化阻斷反義轉錄並穩定DNA雙鏈,從而促使腫瘤細胞能夠在應激條件下繼續增殖的分子機制。

MYC多聚體促腫瘤機制

重組MYC蛋白在體外可以多聚化,這促使作者們思考MYC在細胞中是均勻分佈還是會形成更高階的結構。

透過使用MYC單克隆抗體Y69,作者們分析了MYC在U2OS細胞中的分佈,然後建立單個MYC分子訊號分佈特徵。作者們發現MYC蛋白在細胞中可以形成點狀訊號,

每個細胞核中有180,000 ±90,000個MYC分子

。先前的研究曾經表明,在人類腫瘤細胞中,每個細胞核中的MYC分子數量會達到106個

【4】

,作者們試圖用強力黴素誘導MYC來達到該表達水平。作者們發現

增加MYC水平並不會增加MYC點狀訊號,而是會增加單體MYC分子的比例。

透過使用包括蛋白酶體活性抑制劑MG-132在內等多種體抑制泛素化的藥物,作者們發現會顯著增強MYC點狀訊號的形成

(圖1)

MYC多聚體促腫瘤機制

圖1 MYC點狀訊號形成依賴於泛素化

透過熱激實驗作者們發現也會誘導MYC蛋白形成點狀訊號。透過使用相分離處理藥物1,6-己二醇,可以溶解形成的點狀訊號。熒光漂白恢復實驗室也證明了MYC蛋白在正常細胞中具有高度的動態性。透過使用抗體

臨近連線實驗

(Proximity ligation assays,PLAs)顯示MYC點狀訊號表面產生強烈連線,說明近距離包含多個MYC分子。免疫共沉澱實驗以及體外的蛋白純化實驗也證明了這一觀點。因此,作者們將MYC蛋白所形成的結構稱為

MYC多聚體

(MYC multimers)。

另外,透過使用熒游標記的不同分子量的右旋糖酐的滲透性測定表明,MYC多聚體其表面的拓撲結構是封閉的。部分在細胞內或體外高濃度下形成的MYC多聚體顯示為球狀結構,內部密度較低、外殼緻密,直徑中位數為5µm。透過對MYC蛋白的結構域分析,包含MYC二聚化和DNA結合結構域的MYCΔN並不能在體外形成多聚體,而兩個大的內在無序結構域以及MYC box才是多聚體形成所必需的。

進一步尋找MYC蛋白多聚體作用機制,作者們透過ChIP-Rx染色質免疫沉澱測序實驗顯示,在熱激以及MG-132處理後,RNA Pol II轉錄的基因啟動子和多個非啟動子位點的MYC染色質佔用發生顯著變化。MYC蛋白多聚體排除了pS2-RNA Pol II,表明

該多聚體不是進行活躍轉錄的集合體。

MYC多聚體包含腫瘤抑制蛋白BRCA1、FANCD2和相關性較低的RAD9,它們都與複製叉暫停相關。BRCA1和FANCD2被多聚體MYC形成的多聚體包圍,而不在多聚體內。MYC多聚體內則包圍著磷酸化的ATR激酶。為了定位染色質上停滯的複製叉,作者們使用了FANCD2以及ATR的CUT&RUN測序,發現MYC的敲除會降低這些因子在染色質上的佔用。因此,作者們得出結論,

MYC多聚體聚集在停滯的複製叉處,限制新生轉錄本的累積。

由於抑制蛋白酶體能夠促進MYC蛋白多聚體的形成,說明泛素化對於多聚體的形成非常關鍵。透過小分子抑制劑的篩選,作者們發現泛素化酶HUWE1是驅動MYC多聚化的關鍵蛋白,且主要作用於K6位點。

總的來說,作者們的工作發現MYC蛋白在多種應激條件下,會與多個活性的啟動子結合位點分離形成封閉球狀多聚體,從而參與轉錄終止以及RNA加工的蛋白質全域性變化。另外,在活性啟動子上,MYC多聚體穩定複製叉相關的蛋白與染色質的聯絡,從而保護DNA雙鏈結構的完整,促進腫瘤細胞在應激條件下的增殖。值得一提是該工作具有大規模的測序的資料,給出了MYC多聚體形成對於蛋白質組以及染色質的全域性性影響,同時多個定量化的資料也為MYC多聚體提供了更為直觀的描述。

原文連結:

https://doi.org/10.1038/s41586-022-05469-4

參考文獻

1。 Dhanasekaran, R。 et al。 The MYC oncogene—the grand orchestrator of cancer growth and immune evasion。

Nat. Rev. Clin. Oncol.

19, 23–36 (2022)

2。 Lourenco, C。 et al。 MYC protein interactors in gene transcription and cancer。

Nat. Rev. Cancer

21, 579–591 (2021)。

3。 Baluapuri, A。, Wolf, E。 & Eilers, M。 Target gene-independent functions of MYC oncoproteins。

Nat. Rev. Mol. Cell Biol.

21, 255–267 (2020)。

4。 Lin, C。 Y。 et al。 Transcriptional amplification in tumor cells with elevated c-Myc。

Cell

151, 56–67 (2012)。

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